MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 39245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017516	ACC	2	6	74	79	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852232
2	NC_017516	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852232
3	NC_017516	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385852232
4	NC_017516	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852232
5	NC_017516	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852232
6	NC_017516	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852232
7	NC_017516	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852232
8	NC_017516	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385852232
9	NC_017516	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852233
10	NC_017516	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	385852233
11	NC_017516	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852233
12	NC_017516	TTTTGC	2	12	725	736	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385852233
13	NC_017516	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385852233
14	NC_017516	AAAAT	2	10	823	832	80 %	20 %	0 %	0 %	385852233
15	NC_017516	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385852233
16	NC_017516	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
17	NC_017516	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
18	NC_017516	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852234
19	NC_017516	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852234
20	NC_017516	GTTT	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	385852234
21	NC_017516	GTAGAA	2	12	1200	1211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385852234
22	NC_017516	TCG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
23	NC_017516	CGCAA	2	10	1306	1315	40 %	0 %	20 %	40 %	385852234
24	NC_017516	T	6	6	1389	1394	0 %	100 %	0 %	0 %	385852234
25	NC_017516	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385852234
26	NC_017516	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852234
27	NC_017516	TCG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
28	NC_017516	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385852234
29	NC_017516	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852234
30	NC_017516	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385852234
31	NC_017516	ATC	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852234
32	NC_017516	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852234
33	NC_017516	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
34	NC_017516	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
35	NC_017516	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852234
36	NC_017516	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
37	NC_017516	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852234
38	NC_017516	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852234
39	NC_017516	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
40	NC_017516	ACG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852234
41	NC_017516	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	385852234
42	NC_017516	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
43	NC_017516	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852234
44	NC_017516	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
45	NC_017516	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852234
46	NC_017516	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852234
47	NC_017516	A	6	6	2524	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	385852235
48	NC_017516	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852235
49	NC_017516	T	7	7	2591	2597	0 %	100 %	0 %	0 %	385852235
50	NC_017516	TCC	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852235
51	NC_017516	CCG	2	6	2672	2677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852235
52	NC_017516	CAC	2	6	2709	2714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852235
53	NC_017516	CGGA	2	8	2742	2749	25 %	0 %	50 %	25 %	385852235
54	NC_017516	TGT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852235
55	NC_017516	GC	3	6	2802	2807	0 %	0 %	50 %	50 %	385852235
56	NC_017516	CCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852235
57	NC_017516	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	385852235
58	NC_017516	CGG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852235
59	NC_017516	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852235
60	NC_017516	GCC	2	6	3198	3203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852236
61	NC_017516	GAT	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852236
62	NC_017516	GCA	2	6	3262	3267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852236
63	NC_017516	ATC	2	6	3317	3322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852236
64	NC_017516	CAT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852236
65	NC_017516	CG	3	6	3340	3345	0 %	0 %	50 %	50 %	385852236
66	NC_017516	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852236
67	NC_017516	GCG	2	6	3397	3402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852236
68	NC_017516	GCA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852236
69	NC_017516	TTC	2	6	3440	3445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852236
70	NC_017516	GGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852236
71	NC_017516	TGC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852236
72	NC_017516	GCC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852237
73	NC_017516	ACA	2	6	3723	3728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852237
74	NC_017516	TGCC	2	8	3813	3820	0 %	25 %	25 %	50 %	385852237
75	NC_017516	A	6	6	3845	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	385852237
76	NC_017516	CAAA	2	8	3910	3917	75 %	0 %	0 %	25 %	385852237
77	NC_017516	CGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852237
78	NC_017516	A	6	6	4068	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	385852237
79	NC_017516	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852238
80	NC_017516	CAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852238
81	NC_017516	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852238
82	NC_017516	CCG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852238
83	NC_017516	CGG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852238
84	NC_017516	AAC	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852238
85	NC_017516	CGT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852238
86	NC_017516	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852238
87	NC_017516	CGA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852238
88	NC_017516	GAC	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852238
89	NC_017516	CAT	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852239
90	NC_017516	CG	3	6	4996	5001	0 %	0 %	50 %	50 %	385852239
91	NC_017516	AGC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852239
92	NC_017516	ATG	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852239
93	NC_017516	CGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
94	NC_017516	CCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
95	NC_017516	CTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852239
96	NC_017516	GC	3	6	5213	5218	0 %	0 %	50 %	50 %	385852239
97	NC_017516	ACA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852239
98	NC_017516	AGA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852239
99	NC_017516	GAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852239
100	NC_017516	CGCC	2	8	5364	5371	0 %	0 %	25 %	75 %	385852239
101	NC_017516	TTTC	2	8	5492	5499	0 %	75 %	0 %	25 %	385852239
102	NC_017516	CA	3	6	5532	5537	50 %	0 %	0 %	50 %	385852239
103	NC_017516	AGA	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852239
104	NC_017516	GC	3	6	5598	5603	0 %	0 %	50 %	50 %	385852239
105	NC_017516	CGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852239
106	NC_017516	CCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
107	NC_017516	CCG	3	9	5661	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852239
108	NC_017516	GCT	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852239
109	NC_017516	CT	3	6	5696	5701	0 %	50 %	0 %	50 %	385852239
110	NC_017516	TTC	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852239
111	NC_017516	CCA	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852239
112	NC_017516	A	6	6	5867	5872	100 %	0 %	0 %	0 %	385852239
113	NC_017516	T	6	6	6049	6054	0 %	100 %	0 %	0 %	385852240
114	NC_017516	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852240
115	NC_017516	AAGGC	2	10	6081	6090	40 %	0 %	40 %	20 %	385852240
116	NC_017516	CG	3	6	6097	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	385852240
117	NC_017516	GCAC	2	8	6154	6161	25 %	0 %	25 %	50 %	385852240
118	NC_017516	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852240
119	NC_017516	CGG	2	6	6186	6191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852240
120	NC_017516	AAT	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852240
121	NC_017516	CGC	2	6	6286	6291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
122	NC_017516	GGCA	2	8	6311	6318	25 %	0 %	50 %	25 %	385852241
123	NC_017516	CGC	3	9	6349	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
124	NC_017516	CGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
125	NC_017516	CGC	3	9	6418	6426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852241
126	NC_017516	GCTTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385852241
127	NC_017516	CGG	2	6	6538	6543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
128	NC_017516	ATC	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852241
129	NC_017516	CAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852241
130	NC_017516	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
131	NC_017516	CAC	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852241
132	NC_017516	CGG	2	6	6679	6684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
133	NC_017516	CAC	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852241
134	NC_017516	CGG	2	6	6712	6717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852241
135	NC_017516	ACG	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852241
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246	NC_017516	CG	3	6	12275	12280	0 %	0 %	50 %	50 %	385852246
247	NC_017516	GC	3	6	12305	12310	0 %	0 %	50 %	50 %	385852246
248	NC_017516	AGT	2	6	12314	12319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852246
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250	NC_017516	ACC	2	6	12433	12438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852246
251	NC_017516	GGCA	2	8	12451	12458	25 %	0 %	50 %	25 %	385852246
252	NC_017516	ATG	2	6	12559	12564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852246
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255	NC_017516	ACG	2	6	12782	12787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852246
256	NC_017516	TCAGCG	2	12	12818	12829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385852246
257	NC_017516	CGC	2	6	12917	12922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852246
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259	NC_017516	GGC	2	6	13173	13178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852246
260	NC_017516	GC	3	6	13213	13218	0 %	0 %	50 %	50 %	385852246
261	NC_017516	CCCG	2	8	13224	13231	0 %	0 %	25 %	75 %	385852246
262	NC_017516	CGCGC	2	10	13247	13256	0 %	0 %	40 %	60 %	385852246
263	NC_017516	CTT	2	6	13259	13264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852246
264	NC_017516	CCG	2	6	13267	13272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852246
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266	NC_017516	CCG	2	6	13323	13328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852246
267	NC_017516	TGTCG	2	10	13329	13338	0 %	40 %	40 %	20 %	385852246
268	NC_017516	GCC	2	6	13353	13358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852246
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275	NC_017516	ATC	2	6	15227	15232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852247
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377	NC_017516	CTT	2	6	24152	24157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852256
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380	NC_017516	TGTT	2	8	24293	24300	0 %	75 %	25 %	0 %	385852257
381	NC_017516	T	7	7	24312	24318	0 %	100 %	0 %	0 %	385852257
382	NC_017516	ACG	2	6	24354	24359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852257
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385	NC_017516	CCGG	2	8	24646	24653	0 %	0 %	50 %	50 %	385852258
386	NC_017516	TGA	2	6	24760	24765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852258
387	NC_017516	ATT	2	6	24777	24782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852258
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389	NC_017516	GGC	2	6	24857	24862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852258
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